146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0862 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
389 aa  799    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  77.95 
 
 
390 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  35.83 
 
 
440 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  34.72 
 
 
421 aa  230  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.61 
 
 
444 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  35.28 
 
 
425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  35.28 
 
 
425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  35.28 
 
 
425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  36.78 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  33.98 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  37.25 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  36.68 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  32.75 
 
 
414 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  32.75 
 
 
414 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  32.41 
 
 
420 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  34.1 
 
 
412 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  30.95 
 
 
384 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.94 
 
 
423 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.9 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  29.77 
 
 
408 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  30 
 
 
524 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  31.91 
 
 
416 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  28.74 
 
 
408 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  30.42 
 
 
434 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  28.76 
 
 
445 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  29.94 
 
 
409 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  29.53 
 
 
417 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  28.54 
 
 
436 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.57 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  29.14 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  28.61 
 
 
473 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  29.97 
 
 
444 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  29.67 
 
 
431 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  30 
 
 
392 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.58 
 
 
434 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.74 
 
 
409 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.68 
 
 
424 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.41 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  26.74 
 
 
426 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.9 
 
 
404 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  30.57 
 
 
429 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.93 
 
 
428 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  28.24 
 
 
407 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  28.06 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  30.9 
 
 
408 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.19 
 
 
416 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.19 
 
 
416 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  26.59 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  28.86 
 
 
415 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.27 
 
 
544 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  26.89 
 
 
432 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  27.59 
 
 
411 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.88 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  28.11 
 
 
399 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  26.47 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  30.58 
 
 
460 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  26.53 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  26.69 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  29.85 
 
 
420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.16 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  26.6 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.56 
 
 
455 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  26.02 
 
 
398 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  28.45 
 
 
429 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  24.07 
 
 
428 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.88 
 
 
434 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.5 
 
 
447 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.91 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  27.19 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  26.22 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.69 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.48 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.48 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  22.95 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  22.97 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.88 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  24.43 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  25.37 
 
 
406 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
859 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
833 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
833 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.83 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  25 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.74 
 
 
414 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 
445 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 
445 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.83 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  28.06 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  28.06 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  28.19 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  27.51 
 
 
389 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.7 
 
 
413 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  23.77 
 
 
464 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  29.09 
 
 
393 aa  102  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  23.63 
 
 
437 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  27.58 
 
 
393 aa  99  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  22.99 
 
 
422 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  25.65 
 
 
448 aa  93.6  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>