148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7142 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
524 aa  1094    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  44.13 
 
 
444 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  41.09 
 
 
421 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  40.87 
 
 
420 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  42.9 
 
 
414 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  42.9 
 
 
414 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  42.32 
 
 
440 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  38.48 
 
 
412 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  35.81 
 
 
425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  35.81 
 
 
425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  35.81 
 
 
425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  36.36 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  35.94 
 
 
407 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  33.59 
 
 
413 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  33.59 
 
 
413 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  33.84 
 
 
413 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  36.41 
 
 
408 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  33.77 
 
 
434 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  32.97 
 
 
419 aa  223  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  34.79 
 
 
416 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  34.63 
 
 
408 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  31.02 
 
 
390 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  32.14 
 
 
423 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  36.08 
 
 
409 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  32.97 
 
 
417 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  32.51 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  32.26 
 
 
407 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.15 
 
 
436 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.24 
 
 
404 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  31.82 
 
 
417 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  32.63 
 
 
431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  32.63 
 
 
444 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  29.82 
 
 
426 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30 
 
 
389 aa  181  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  31.47 
 
 
434 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  29.86 
 
 
415 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  33.8 
 
 
428 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  31.07 
 
 
445 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.59 
 
 
409 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  30.83 
 
 
420 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  31.4 
 
 
434 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  30.45 
 
 
432 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  29.43 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  31.39 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.23 
 
 
473 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  32.58 
 
 
398 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  31.62 
 
 
416 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  31.31 
 
 
416 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  28.66 
 
 
412 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  29.49 
 
 
544 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  31.07 
 
 
429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.37 
 
 
416 aa  156  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 
411 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.2 
 
 
397 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  28.86 
 
 
428 aa  148  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  29.63 
 
 
411 aa  143  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  27.25 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  28 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  29.66 
 
 
395 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  27.14 
 
 
455 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  27.35 
 
 
407 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  28.69 
 
 
392 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  28.49 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
859 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
833 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
833 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.78 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.81 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.81 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  27.25 
 
 
393 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.92 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  26.57 
 
 
460 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
454 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
454 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  26.79 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  26.69 
 
 
429 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.88 
 
 
436 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.88 
 
 
436 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  26.55 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  36.23 
 
 
225 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  25.53 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  29.17 
 
 
542 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  26.76 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.93 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.2 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  26.16 
 
 
414 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.79 
 
 
455 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  26.6 
 
 
417 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  24.65 
 
 
457 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  23.69 
 
 
422 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  26.55 
 
 
391 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.54 
 
 
441 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.77 
 
 
464 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  29.34 
 
 
264 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  26.88 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  23.99 
 
 
437 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  26.1 
 
 
401 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  24.93 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  25.37 
 
 
435 aa  94.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
391 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>