140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4113 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 455 aa  936    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  60.82 
 
 		 455 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  64.41 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  64.41 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  62.11 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  56.97 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  53.37 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  51.19 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  51.19 
 
 		 859 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  51.19 
 
 		 833 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  50.12 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.67 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  30.56 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  28.03 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  29.15 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  29.59 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.4 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  27.59 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  27.71 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  27.7 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  27.7 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  27.7 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  28.02 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.82 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  26.42 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.49 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  26.17 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  28.02 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.18 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  26.39 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  27.32 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.25 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25 
 
 		 411 aa  117  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.02 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  29.19 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  26.04 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  28.61 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  26.05 
 
 		 384 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  26.87 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.48 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.68 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  29.12 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.9 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.11 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  26.14 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  26.76 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.77 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  25.19 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  24.8 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.21 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  25.82 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  27.45 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  22.93 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  27.12 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  27.04 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  25.84 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  22.92 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  25.65 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  28.63 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  23.84 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  25.28 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.6 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 398 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.67 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  26.11 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  25.07 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  28.01 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  25.68 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  26.52 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  25 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  27.47 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.25 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  25.93 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.48 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  25.14 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25.07 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25.07 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  27.9 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  22.19 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.14 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  25.13 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  28.82 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  24.73 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  28.72 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  31.58 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  26.64 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  25.98 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.61 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>