150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1188 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  99.27 
 
 		 413 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  98.79 
 
 		 413 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 413 aa  866    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  95.86 
 
 		 157 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  40.32 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  37.94 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  40.1 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  39.66 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  39.01 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  38.74 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  38.8 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  36.79 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  35.81 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  36.52 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36.82 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  33.95 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  33.84 
 
 		 524 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  34.2 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  34.35 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  34.35 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  33.52 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  37.25 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  35.47 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  32.16 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  33.06 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  32.97 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  32.99 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  33.51 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.39 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  30.23 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  32.26 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  32.21 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  32.26 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  32.26 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  32.68 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  32.33 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.23 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  30.59 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.3 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.69 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  32.96 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  31.03 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  33.33 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.95 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  30.22 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  30.37 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  29.79 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.51 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  31.25 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  31.44 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  30.6 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  33.05 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.71 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  31 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.07 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  32 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  30.34 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  29.53 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.72 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  27.75 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  29.4 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.12 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.91 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  28.2 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 		 544 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  30.15 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.93 
 
 		 464 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  28.13 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.72 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  28.64 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.68 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.69 
 
 		 436 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.69 
 
 		 436 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  26.9 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.65 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.65 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.4 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.03 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.89 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  37.07 
 
 		 225 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.65 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  26.42 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.87 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  24.13 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.86 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 		 833 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 		 859 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  31.1 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.8 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  24.18 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.18 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  24.37 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 		 454 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 		 454 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>