103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1303 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
437 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  31.44 
 
 
440 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  31.38 
 
 
414 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  31.38 
 
 
414 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  30.51 
 
 
420 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  29.47 
 
 
444 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  29.19 
 
 
425 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  29.19 
 
 
425 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  29.19 
 
 
425 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  31.13 
 
 
542 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  29.97 
 
 
421 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  28.32 
 
 
445 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.71 
 
 
434 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  26.67 
 
 
416 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  27.03 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  27.59 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
413 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
413 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.65 
 
 
407 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  27.35 
 
 
431 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  27.35 
 
 
444 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
417 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.49 
 
 
409 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  28.81 
 
 
409 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.95 
 
 
419 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.2 
 
 
407 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  27.54 
 
 
432 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  28.41 
 
 
434 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.35 
 
 
424 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.43 
 
 
436 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.43 
 
 
436 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  23.92 
 
 
390 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  22.84 
 
 
434 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.23 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  23.63 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  23.99 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.9 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  28.91 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  28.25 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  26.61 
 
 
429 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.36 
 
 
411 aa  93.2  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  26.94 
 
 
408 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  28.96 
 
 
397 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.58 
 
 
423 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 
429 aa  90.1  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  28.7 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  31.82 
 
 
225 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  28.91 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  25.66 
 
 
395 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  23.58 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  27.67 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  26.57 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  26.76 
 
 
414 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.15 
 
 
398 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  24.94 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  26.72 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  22.13 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  22.96 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  23.7 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  22.35 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  24.8 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  23.73 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.8 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  22.31 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.94 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.33 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  24.7 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  21.55 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  22.95 
 
 
407 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  22.29 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  27.76 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  23.03 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 
859 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 
833 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 
833 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  27.51 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  26.7 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.83 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.83 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  24.06 
 
 
426 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  25.96 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  22.36 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  27.02 
 
 
400 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  22.25 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  22.82 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  22.25 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  25.6 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  25.16 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  23.05 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  22.08 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  22.89 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>