113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1648 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2583  hypothetical protein  94.74 
 
 		 123 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  28.2 
 
 		 408 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  27.13 
 
 		 423 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  29.49 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  26.65 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  29.36 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  26.36 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.65 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  30.26 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  26.15 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  26.12 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.08 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  24.88 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  29.51 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.21 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.21 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.21 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  27.06 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.61 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  24.64 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  22.83 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  24.64 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  28.09 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.02 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  23.71 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  27.3 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  29.64 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  28.68 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.03 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.47 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  26.26 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.86 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  23.63 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  22.88 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.36 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.53 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.99 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25.51 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  29.17 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.63 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  27.87 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  25.63 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  22.31 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.14 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  27.48 
 
 		 473 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  24.02 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.97 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  26.24 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.2 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.42 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  26.26 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  26.23 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  22.31 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  24.46 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.06 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.18 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  22.7 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  26.47 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  22.71 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  24.73 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  23.68 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  24.17 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.65 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  29.26 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25.28 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  21.49 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  21.49 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  24.09 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.86 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.86 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.02 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.58 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.11 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.72 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  23.69 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  27.96 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  23.69 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.36 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.93 
 
 		 833 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.93 
 
 		 859 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.93 
 
 		 833 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.08 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  25.12 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  24.79 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  21.35 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  21.35 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  24.24 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.26 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.26 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  24.16 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  23.94 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  22.87 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>