72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2495 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
157 aa  329  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  95.86 
 
 
413 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  97.14 
 
 
413 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  97.14 
 
 
413 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  39.86 
 
 
444 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  38.39 
 
 
524 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  37.72 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  38.46 
 
 
416 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  35.05 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  34.16 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  41.35 
 
 
420 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  34.17 
 
 
434 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  38.82 
 
 
431 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.07 
 
 
412 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 
417 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  38.82 
 
 
444 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  30.33 
 
 
424 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  34.26 
 
 
434 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  28.12 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  35.05 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  38.1 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  28.15 
 
 
408 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  31.39 
 
 
434 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.03 
 
 
384 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  37.86 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  33 
 
 
425 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  33 
 
 
425 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  33 
 
 
425 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  33.58 
 
 
440 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  32 
 
 
416 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  32 
 
 
416 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 
445 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 
445 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  31.62 
 
 
409 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  32.09 
 
 
421 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  33.65 
 
 
413 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  36.54 
 
 
414 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  35.58 
 
 
414 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.37 
 
 
436 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  32.38 
 
 
426 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  37.11 
 
 
419 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  35.79 
 
 
429 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  35.35 
 
 
423 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.76 
 
 
409 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  33.68 
 
 
460 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  30.91 
 
 
445 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.91 
 
 
420 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  25.95 
 
 
412 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  34.51 
 
 
404 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  29.7 
 
 
428 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.36 
 
 
417 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  33.67 
 
 
420 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.03 
 
 
415 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  33.68 
 
 
411 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  33.7 
 
 
407 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.99 
 
 
408 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  34.09 
 
 
414 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  31.65 
 
 
390 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.56 
 
 
411 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  30.88 
 
 
413 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.84 
 
 
417 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.32 
 
 
406 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  31.13 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  34.67 
 
 
389 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3509  hypothetical protein  28.46 
 
 
403 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3786  hypothetical protein  28.46 
 
 
403 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  25.76 
 
 
408 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5837  phage-related, head portal protein  29.23 
 
 
408 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3430  HK97 family phage portal protein  27.78 
 
 
404 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3426  phage-related, head portal protein  28.24 
 
 
403 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  26.04 
 
 
428 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0153  HK97 family phage portal protein  36.07 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.924925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>