129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1045 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  100 
 
 
460 aa  945    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  90.89 
 
 
429 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  54.73 
 
 
420 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  44.5 
 
 
414 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  32.96 
 
 
413 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.69 
 
 
413 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  32.69 
 
 
413 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  29.97 
 
 
408 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  30.97 
 
 
424 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  32.59 
 
 
412 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  31.49 
 
 
444 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.25 
 
 
384 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  31.55 
 
 
421 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  29.83 
 
 
440 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  27.46 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  29.09 
 
 
420 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  30.03 
 
 
407 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  28.42 
 
 
414 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.42 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  32.49 
 
 
473 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  28.93 
 
 
409 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  29.9 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  31.71 
 
 
416 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  28.26 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  32.84 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  32.68 
 
 
434 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  29.67 
 
 
544 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  28.3 
 
 
411 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.78 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30.58 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  29.17 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.44 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  29.52 
 
 
444 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.57 
 
 
524 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  28.15 
 
 
432 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  30.29 
 
 
401 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  27.39 
 
 
407 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  29.03 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  27.86 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.42 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.98 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.28 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  27.99 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 
417 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.64 
 
 
416 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.78 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  27.54 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  24.12 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  25.19 
 
 
420 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  30.62 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.98 
 
 
392 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  27.32 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.05 
 
 
445 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  28.05 
 
 
445 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  23.53 
 
 
411 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 
425 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  27.78 
 
 
393 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  28.47 
 
 
542 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  28.08 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.12 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.25 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25.97 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.49 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  28.24 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  22.54 
 
 
413 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.19 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.96 
 
 
392 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.74 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  22.64 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.64 
 
 
422 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.06 
 
 
399 aa  86.7  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.02 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  25.14 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.01 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.25 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.25 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  25.06 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  22.22 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  26.62 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.56 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.21 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  24.39 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  24.39 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  27.85 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  26.24 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.08 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.82 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  22.79 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  17.75 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  27.04 
 
 
400 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  23.95 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.53 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  23.24 
 
 
833 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  23.24 
 
 
859 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>