144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1680 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 416 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  56.48 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  56.07 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  46.55 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  47.92 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  45.45 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  47.22 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  47.03 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  44.76 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  47.73 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  43.73 
 
 		 445 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  41.39 
 
 		 416 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  41.13 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  40.57 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  40.32 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  40.87 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  39.76 
 
 		 445 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  39.76 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  41.46 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  41.18 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36.46 
 
 		 421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  37.69 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  41.1 
 
 		 384 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  37.08 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  36.8 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  36.52 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  34.84 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  34.84 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  34.84 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  37.46 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  37.23 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  34.79 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  36.41 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  32.11 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  34.7 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  34.08 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  32.53 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  32.13 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  32.6 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.56 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.5 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.82 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  33.79 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  33.07 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  32.74 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  31.07 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  31.91 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  33.06 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  31.58 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  32.85 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.49 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.65 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  28.12 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  30.71 
 
 		 542 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  31.78 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  31.11 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  32.58 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  30.68 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  31.18 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  28.43 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  28.43 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.88 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  37.62 
 
 		 225 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  29.86 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.53 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  31.19 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  30.66 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  31.71 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  29.73 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.42 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  29.18 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  28.91 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  31.28 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  28.9 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 		 833 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 		 833 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 		 859 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.55 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  28.18 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  28.02 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  28.87 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  28.65 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.97 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  28.61 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  29.86 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  28.39 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.97 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.97 
 
 		 389 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.79 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  22.65 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  24.66 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.96 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  27.07 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  23.28 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  28.85 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  26.3 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  27.53 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.07 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  25.36 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>