144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1682 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  100 
 
 		 407 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  55.33 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  39.28 
 
 		 444 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  39.02 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  36.34 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  38.3 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36.32 
 
 		 421 aa  258  9e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  38.13 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  35.94 
 
 		 524 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  36.41 
 
 		 473 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  35.47 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  31.87 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  34.92 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  32.71 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  34.92 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  33.43 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  32.13 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.29 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  30.21 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  29.52 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32.68 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  32.5 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  28.9 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  33.71 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29.63 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  30.84 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  30.84 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  30.84 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  30.15 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.13 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  29.89 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  30.6 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  30.61 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  30.7 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.91 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  27.5 
 
 		 415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  27.59 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  28.08 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  28.03 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  28.21 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29.82 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  30.66 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  30.75 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  31.64 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.29 
 
 		 544 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.93 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  26.2 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  28 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  29.48 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  28.99 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  28.61 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  29.87 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  27.64 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.94 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.48 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  35.98 
 
 		 225 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.13 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  27.3 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.2 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.53 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.53 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  29.14 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  27.12 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  26.65 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.66 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.39 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.35 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  28.28 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  26.94 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  26.84 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.37 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  27.03 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  27.03 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  27.64 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.08 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.66 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.66 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.5 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  23.35 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 		 542 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.07 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  23.24 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  23.97 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.2 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.1 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.07 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  24.52 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  22.92 
 
 		 455 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.16 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  22.88 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.25 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3716  portal protein  25.14 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3767  portal protein  25.14 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  22.74 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  23.31 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  23.31 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.2 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.2 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  24.68 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>