79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3716 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3767  portal protein  100 
 
 		 404 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3716  portal protein  100 
 
 		 404 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  23.47 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  25.14 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  23.61 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  23.18 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  22.84 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  24.38 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  22.91 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  22.13 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  23.39 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.52 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  24.49 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  23.28 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  23.21 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  24.3 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  23.21 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  23.21 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  24.18 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  21.57 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  21.05 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  23.77 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  23.98 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  24.09 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.16 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  23.58 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  23.47 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  25.69 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  23.94 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.46 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  23.14 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  21.34 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.1 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  23.53 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  23.19 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  21.25 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.84 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.22 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  23.4 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.07 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.07 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  21.98 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  22.48 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  22.85 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  26.45 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  22.67 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  20.87 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.35 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  22.57 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.45 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  22.86 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.75 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  20.26 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  22.96 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  22.19 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  24.02 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  19.32 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  24.58 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  23.26 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.58 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.13 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  22.29 
 
 		 455 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  23.35 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  19.2 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  23.23 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  20.33 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  25.26 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  22.04 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  24.3 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  23.85 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  24.84 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  22.15 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  22 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1116  HK97 family phage portal protein  22.76 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  22.3 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  23.2 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>