35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3484 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3484  portal protein  100 
 
 		 460 aa  960    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  24.3 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  23.85 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  24.16 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  23.45 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  26.91 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  22.56 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  22.14 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  25.3 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  22.94 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  22.25 
 
 		 397 aa  63.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  21.73 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  23.84 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  23.89 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  19.95 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  19.95 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  23.73 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  26.67 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  24.62 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  21.54 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  21.37 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  25.5 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  24.83 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  20 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  26.57 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  28.43 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  25.21 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  23.12 
 
 		 400 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  22.98 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  20 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  23.23 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  23.4 
 
 		 1102 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  25.58 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  25.58 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.6 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>