88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3880 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  100 
 
 		 479 aa  999    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  23.73 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.43 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  24.07 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  25.15 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  25.22 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.29 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  25.87 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.07 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  22.64 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  24.34 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  22.94 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  22.39 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  24.3 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  24.37 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  22.75 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  22.61 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  21.46 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  22.17 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  21.92 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  23.77 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  23.2 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  24.53 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  26.79 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  22.83 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  22.49 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  26.79 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.7 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.7 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  24.36 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.73 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  21.43 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  25.46 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  23.17 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  21.88 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  25.16 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 833 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 833 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  18.9 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  20.59 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  23.72 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  24.28 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  20.38 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.52 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  24.52 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  22.52 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  22.44 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  23.14 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  20.53 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  22.09 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  22.54 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  22.97 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  23.3 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  20.35 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  21.52 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  20.92 
 
 		 416 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  22.64 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  20.92 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  22.06 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  20.85 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  22.62 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  22.08 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  23.03 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  23.03 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  22.97 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  23.31 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.11 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.51 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.89 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.34 
 
 		 390 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  20.17 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  23.81 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  18.84 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  18.84 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  18.84 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  21.41 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.08 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  22.03 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  25.31 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  20.78 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  18.84 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  22.51 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  20.39 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.23 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.23 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.84 
 
 		 436 aa  43.5  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>