53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5051 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  55.56 
 
 		 338 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  52.14 
 
 		 347 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  52.97 
 
 		 347 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  54.35 
 
 		 344 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  51.17 
 
 		 348 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  51.27 
 
 		 340 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  48.15 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  45.96 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  45.58 
 
 		 341 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  48.36 
 
 		 346 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  46.48 
 
 		 335 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  44.2 
 
 		 356 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  44.14 
 
 		 353 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  43.69 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  42.67 
 
 		 351 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  42.67 
 
 		 351 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  42.67 
 
 		 351 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  44.86 
 
 		 339 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  42.67 
 
 		 351 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  42.22 
 
 		 343 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  41.96 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  42.79 
 
 		 337 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  42.79 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  42.79 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  42.04 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  42.34 
 
 		 363 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  42.34 
 
 		 363 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  42.34 
 
 		 363 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  42.34 
 
 		 363 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  41.85 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  42.34 
 
 		 337 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  43.24 
 
 		 346 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  41.45 
 
 		 342 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  41.33 
 
 		 348 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  40.97 
 
 		 342 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  40.44 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  41.52 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  40.26 
 
 		 339 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  40.97 
 
 		 341 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  39.66 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  41.89 
 
 		 350 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  39.64 
 
 		 350 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  40.09 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  41.26 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  40.71 
 
 		 350 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  38.22 
 
 		 345 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  39.19 
 
 		 344 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  39.19 
 
 		 344 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  40.35 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  36.59 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  25.75 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>