55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2801 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  100 
 
 
339 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  69.91 
 
 
341 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  63.64 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  63.53 
 
 
353 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  45.69 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  44.89 
 
 
348 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  45.02 
 
 
335 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  44.34 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  42.77 
 
 
344 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  38.01 
 
 
347 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  37.65 
 
 
347 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  36.39 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  36.01 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  44.86 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  44.86 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  35.22 
 
 
339 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  32.48 
 
 
344 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  32.91 
 
 
338 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  33.12 
 
 
345 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  35.47 
 
 
356 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  34.87 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  34.43 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  32.01 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  31.71 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  31.71 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  34.43 
 
 
344 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  31.71 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  35.41 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  32.04 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  32.04 
 
 
337 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  32.04 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  31.72 
 
 
363 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  31.72 
 
 
363 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  31.72 
 
 
363 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  31.72 
 
 
363 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  31.72 
 
 
337 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  34.77 
 
 
342 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  34.77 
 
 
343 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  38.02 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  34.44 
 
 
342 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  37.36 
 
 
350 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  34.44 
 
 
341 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  30.12 
 
 
348 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  34.44 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  36.02 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  33.33 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  35.21 
 
 
361 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  34.01 
 
 
341 aa  173  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  30.95 
 
 
350 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  33.45 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  66.35 
 
 
121 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  41.72 
 
 
180 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  25.63 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4257  portal protein  24.06 
 
 
515 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  21.3 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>