46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0944 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  100 
 
 		 121 aa  246  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  66.35 
 
 		 339 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  66.98 
 
 		 341 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  57.89 
 
 		 353 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  57.89 
 
 		 353 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  51.02 
 
 		 344 aa  103  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  45.71 
 
 		 346 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  45.71 
 
 		 348 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  47.62 
 
 		 335 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  42.86 
 
 		 340 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  37 
 
 		 347 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  36 
 
 		 347 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  36.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  36.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  36.73 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  31.11 
 
 		 344 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  33.67 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  33.67 
 
 		 342 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  33.67 
 
 		 343 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  33.67 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  37.65 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  37.21 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  30.93 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  37.21 
 
 		 351 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  37.65 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  37.65 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  37.21 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  37.65 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  37.21 
 
 		 351 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  37.65 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  32 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  37.65 
 
 		 363 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  37.21 
 
 		 351 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  37.21 
 
 		 337 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  30.93 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  32.65 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  32.65 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  31.96 
 
 		 339 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  32.65 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  28.87 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  28.87 
 
 		 345 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  29.9 
 
 		 341 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  28.28 
 
 		 343 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  29.89 
 
 		 348 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  28.87 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  28.12 
 
 		 355 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>