53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1281 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 346 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  85.63 
 
 		 348 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  50.59 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  51.46 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  50.96 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  45.65 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  44.71 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  44.24 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  45.69 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  39.75 
 
 		 347 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  39.02 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  40 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  48.36 
 
 		 235 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  48.36 
 
 		 235 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  36.99 
 
 		 338 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  35.85 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  35.74 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  35.74 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  35.74 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  35.74 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  36 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  35.9 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  36.89 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  36.6 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  36.6 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  36.6 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  36.36 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  36.6 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  36.6 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  36.91 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  36.6 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  36.6 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  36.6 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  35.58 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  35.69 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  35.39 
 
 		 348 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  34.8 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  33.68 
 
 		 348 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  34.04 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  33.77 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  35.02 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  32.57 
 
 		 345 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  35.22 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  34.34 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  35.98 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  35.98 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  34.43 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  32.2 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  33.22 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  32.47 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  48.3 
 
 		 180 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  45.71 
 
 		 121 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  30.28 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>