57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0694 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 338 aa  703    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  48.65 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  47.65 
 
 		 347 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  47.63 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  45.48 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  55.56 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  55.56 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  42.46 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  41.37 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  39.45 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  38.66 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  39.75 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  38.58 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  38.58 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  38.58 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  38.58 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  38.37 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  39.24 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  40.98 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  39.51 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  39.94 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  40.25 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  39.69 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  39.74 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  39.74 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  39.74 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  40.91 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  38.79 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  39.74 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  40.58 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  40.19 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  40.58 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  40.58 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  40.26 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  39.87 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  38.49 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  38.89 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  39.56 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  41.32 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  39.93 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  38.87 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  38.76 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  36.45 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  36.45 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  37.7 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  35.24 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  36.39 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  36.91 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  36 
 
 		 346 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  37 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  40.37 
 
 		 180 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  23.76 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3263  bacteriophage capsid portal protein  45.71 
 
 		 99 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0311  portal protein PBSX family, truncation  35.96 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0856  hypothetical protein  35.96 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.045604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  32 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  26.9 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>