63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1719 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1719  phage integrase family protein  100 
 
 		 231 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 403 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  34.57 
 
 		 389 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  32.54 
 
 		 392 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 393 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  29.26 
 
 		 390 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3485  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.123113  hitchhiker  0.00059413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3252  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2553  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3389  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1980  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00038231  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1975  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00750912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1863  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000174974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3361  hypothetical protein  46.32 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2030  hypothetical protein  46.32 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0448496  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  31.03 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  30.61 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.77 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.77 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  27.49 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3259  hypothetical protein  35.23 
 
 		 119 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00195671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  28.08 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 393 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0747  hypothetical protein  75 
 
 		 117 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3608  hypothetical protein  75 
 
 		 105 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00133463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0777  hypothetical protein  75 
 
 		 117 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.775621  hitchhiker  0.00416665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  28.91 
 
 		 385 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  21.43 
 
 		 387 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1657  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0789823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  24.86 
 
 		 443 aa  51.6  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.41 
 
 		 406 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0774  hypothetical protein  71.43 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0098879  normal  0.248143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.91 
 
 		 414 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.91 
 
 		 414 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 396 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  25.81 
 
 		 422 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  20.79 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  37.1 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.49 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  21.05 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  22.7 
 
 		 409 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  30 
 
 		 427 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  23.42 
 
 		 414 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 		 409 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  28.07 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  21.72 
 
 		 400 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  21.29 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  28.75 
 
 		 401 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  21.26 
 
 		 379 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  23.86 
 
 		 415 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  22.16 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0897  integrase family protein  24.66 
 
 		 553 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.35 
 
 		 363 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  24.81 
 
 		 429 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 425 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  22.78 
 
 		 618 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.67 
 
 		 439 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>