86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2915 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  53.94 
 
 		 286 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  55.32 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  52.8 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  52.8 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  53.33 
 
 		 285 aa  262  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  51.2 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  51.2 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  51.26 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  51.26 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  35.94 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  38.3 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.56 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  33.04 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.56 
 
 		 241 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.58 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  34.23 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  31.51 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  33.63 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.79 
 
 		 2213 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  32.1 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  31.92 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  30.08 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.82 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.74 
 
 		 230 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  28.51 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.97 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  23.6 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  24.89 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.07 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  22.83 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  23.9 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  23.22 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  23.13 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  27.1 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  26.25 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  22.77 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  23.91 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  22.77 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  22.77 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  25.61 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  23.04 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 		 1047 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  22.32 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  21.58 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  28.25 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.36 
 
 		 502 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.58 
 
 		 502 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.27 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  23.02 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  23.45 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  21.74 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.51 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.44 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  20.16 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.77 
 
 		 1047 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  21.21 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  20.5 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  24.49 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  24.5 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.31 
 
 		 489 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  25.31 
 
 		 489 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 609 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  23.53 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  23.97 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.31 
 
 		 489 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  19.22 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 252 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>