47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1044 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  97.2 
 
 		 286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  94.41 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  93.71 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  75.79 
 
 		 285 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  76.4 
 
 		 285 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  74.91 
 
 		 285 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  74.91 
 
 		 285 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  56.87 
 
 		 286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  51.2 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  36.36 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  35.14 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  34.05 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.75 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  33.77 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  34.22 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  34.22 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.12 
 
 		 2213 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.6 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  33.78 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  31.76 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  29.75 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  32.52 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  28.07 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  28.77 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.57 
 
 		 230 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.83 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  27.68 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  22.02 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.93 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  23.55 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  21.03 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  21.62 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  21.37 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  22.51 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  22.51 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  24.05 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  23.75 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  20.08 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>