26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2369 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  37.77 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  32.19 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  28.3 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25.88 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25.44 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  23.26 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  27.98 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  26.15 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 		 285 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  21 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  26.9 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  24.44 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.45 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  24.66 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>