More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0794 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0794  aminotransferase, class V  100 
 
 		 363 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0401124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2797  aminotransferase, class V  59.89 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.095242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0052  aminotransferase, class V  60.6 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0175702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.07 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  38.83 
 
 		 507 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  38.3 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.24 
 
 		 400 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.24 
 
 		 384 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.38 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.4 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  41.07 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  38.28 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  36.7 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.16 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  38.52 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  36.39 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  42.4 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  36.03 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  41.53 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  37.93 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  39.62 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  39.62 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  35.88 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  39.19 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 1143 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  36.53 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  35.08 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  38.06 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  36.46 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  37.93 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  40.69 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  38.58 
 
 		 383 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  34.9 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  36.1 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.33 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  35.03 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  36.87 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.32 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  35.14 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  37.3 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  36.1 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  38.99 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  37.53 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  35.73 
 
 		 388 aa  198  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.73 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  39.26 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  39.31 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  37.23 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2990  aminotransferase, class V  37.05 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.46909  normal  0.329758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  37.33 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.62 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  36.6 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  35.81 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  37.43 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  39.3 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  35.37 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  38.07 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  38.89 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  37.93 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.81 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  34.88 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 1139 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  37.93 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.87 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  38.99 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  38.99 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  38.2 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  34.88 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 404 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  37.5 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  37.77 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  39.43 
 
 		 406 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  37.57 
 
 		 502 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  35.01 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>