More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0052 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0052  aminotransferase, class V  100 
 
 		 364 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0175702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2797  aminotransferase, class V  66.95 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.095242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0794  aminotransferase, class V  60.6 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0401124 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.5 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  45.74 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.58 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  44.69 
 
 		 493 aa  279  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  47.47 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.15 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  43.8 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  43.8 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  43.7 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.48 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  41.64 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.27 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.62 
 
 		 421 aa  269  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  45.28 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.48 
 
 		 384 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.62 
 
 		 407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  45.77 
 
 		 408 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  44.06 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  42.86 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  42.86 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  41.64 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  44.71 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  44.59 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  44.74 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  44.53 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  44.8 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.33 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  45.33 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  44.95 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 404 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  44.71 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  41.91 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.48 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  45.33 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  45.26 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  45.26 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  44.53 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  46.05 
 
 		 406 aa  261  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  44 
 
 		 403 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  44.02 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  42.37 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  43.92 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  44.8 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.36 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.05 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  44.03 
 
 		 411 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 404 aa  258  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 380 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  43.12 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  42.93 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.44 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.43 
 
 		 396 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.86 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  43.27 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  43.2 
 
 		 430 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  42.4 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  42.97 
 
 		 502 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  45.53 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  42.59 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  43.16 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>