More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2797 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2797  aminotransferase, class V  100 
 
 		 360 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.095242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0052  aminotransferase, class V  66.12 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0175702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0794  aminotransferase, class V  59.89 
 
 		 363 aa  362  6e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0401124 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  43.09 
 
 		 507 aa  258  9e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  42.9 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  43.35 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  44 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.81 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  41.02 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  37.73 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  45.78 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  40.48 
 
 		 388 aa  242  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.92 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  44.14 
 
 		 407 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  44.14 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  43.02 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  43.2 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  41.86 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  38.59 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 410 aa  238  9e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.78 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  39.78 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.98 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.27 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  38.61 
 
 		 415 aa  235  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 404 aa  235  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.92 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  39.78 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  40.93 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  42.25 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  42.32 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.26 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.78 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 407 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  42.47 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 404 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  42.05 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  42.05 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  38.69 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  42.05 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.58 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.58 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  41.16 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 384 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  41.94 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  40.85 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  41.18 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  41.64 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.5 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  40.38 
 
 		 405 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  39.89 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>