More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1890 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 164 aa  314  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  95.73 
 
 		 164 aa  273  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  76.07 
 
 		 169 aa  241  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  74.68 
 
 		 166 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  74.05 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  75.64 
 
 		 166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 166 aa  229  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  86.54 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  71.43 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  73.08 
 
 		 168 aa  207  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  67.31 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  64.74 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  67.08 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  67.74 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.72 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  68.67 
 
 		 166 aa  203  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 164 aa  203  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  68 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  68 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  67.31 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  68.92 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.1 
 
 		 166 aa  193  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  63.51 
 
 		 206 aa  190  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  61.69 
 
 		 173 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 169 aa  187  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.82 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 163 aa  184  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 180 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  59.26 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.64 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  63.4 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 182 aa  178  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  63.4 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 200 aa  177  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  59.38 
 
 		 210 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 210 aa  173  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 234 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  56.05 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 205 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  58.97 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  59.03 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 147 aa  171  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  53.46 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 223 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 223 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 223 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  60.78 
 
 		 208 aa  170  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 174 aa  170  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.8 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  50.61 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>