More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1780 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1780  transporter, putative  100 
 
 		 393 aa  786    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2250  major facilitator transporter  75.13 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2211  major facilitator transporter  75.13 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.01 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  26.61 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.96 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  28.46 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  23.31 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 461 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  24.55 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.59 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  24.43 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.94 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 440 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.86 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.81 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 476 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  23.37 
 
 		 452 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 431 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  26.53 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  23.87 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.25 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  24.04 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 474 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  24.55 
 
 		 423 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 446 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  24.32 
 
 		 553 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  23.84 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  21.67 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  22.61 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  23.69 
 
 		 553 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  25 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>