More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0670 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0670  cylF protein  100 
 
 		 317 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29790  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.48 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.56 
 
 		 340 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.56 
 
 		 370 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.65 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  25.39 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  26.15 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  26.54 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.71 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  23.66 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  29 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.39 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  23.85 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.83 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.52 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.74 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.74 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.09 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  24.64 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  22.56 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.72 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.05 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  26.46 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.02 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.42 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.65 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  25.71 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  24.65 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.66 
 
 		 963 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  24.58 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.15 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  22.69 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  22.78 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.08 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  24.5 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.9 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.87 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.54 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.91 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  23.4 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  24.2 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  24.2 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  22.64 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  27.06 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.33 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.64 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  22.88 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  23.4 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  25.81 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.71 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.56 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  27.27 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  23.6 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.03 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.66 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  22.96 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  26.79 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2576  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.78 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213671  normal  0.0237764 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  21.97 
 
 		 977 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.71 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.8 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  23.45 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  23.1 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5019  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.59 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  24.42 
 
 		 987 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  24.77 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  23.47 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  25.85 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.85 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.8 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  21.93 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  22.09 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  24.88 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  23.08 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.36 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.1 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.23 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  25.67 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.23 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.57 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  23.14 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.75 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.5 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.35 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.54 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  24.66 
 
 		 985 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.96 
 
 		 987 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.98 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  20.94 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>