More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29790  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  100 
 
 		 346 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.43 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.27 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.37 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0670  cylF protein  27.48 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  30.77 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.94 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.55 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  31.11 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.71 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  26.25 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.46 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.72 
 
 		 364 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  31.35 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  27.62 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.3 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.3 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.03 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.66 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.34 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  31.36 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.33 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  30.19 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.23 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.17 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.98 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.17 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.29 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  29.01 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.87 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  32.35 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  28.66 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.5 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  28.99 
 
 		 365 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.49 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  30.12 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  29.71 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.41 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.94 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  31.4 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  25.47 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  27.86 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  27.5 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  29.23 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.58 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  28.29 
 
 		 374 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  26.22 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  26.14 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  28.61 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  30 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 378 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.04 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  25.55 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.9 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  29.7 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0316  glycine cleavage system T protein  31.23 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.55 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.51 
 
 		 441 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1287  putative aminomethyltransferase  26.69 
 
 		 386 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.93 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.23 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.69 
 
 		 752 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.98 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5194  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.23 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.3 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.57 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.3 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.54 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  25.58 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.61 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.95 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.6 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.95 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.7 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  28.7 
 
 		 383 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  29.07 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.54 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  25.55 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.88 
 
 		 363 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.19 
 
 		 375 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.01 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.41 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.38 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  25.16 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.77 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.01 
 
 		 372 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.01 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47280  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.26 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  29.65 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.01 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>