More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1287 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1287  putative aminomethyltransferase  100 
 
 		 386 aa  794    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.02 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.75 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.59 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  26.82 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.27 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.68 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  25.75 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.02 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  25.2 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.45 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.62 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.2 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  24.93 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.5 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  24.45 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.13 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.38 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  25.45 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  27.84 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.56 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29790  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.69 
 
 		 346 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  24.19 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.84 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.85 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  25.36 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  26.1 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.49 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  24.71 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  26.09 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  25.14 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.8 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  26.18 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  25.99 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  24.21 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.81 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.65 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  26.01 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.51 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.54 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.53 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  25.15 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  25.21 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.19 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  25.88 
 
 		 961 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.27 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  24.14 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.63 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.27 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3160  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.19 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.94655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.15 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  26.25 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  25.51 
 
 		 372 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.2 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3211  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.97 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00211141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  25.07 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.63 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  27.46 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.67 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0833  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.59 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00162887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3293  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.62 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.63 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.63 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  25.78 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.35 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.63 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.02 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.51 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.98 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.35 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.98 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3303  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 364 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00589278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3487  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.94 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3677  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.593611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3801  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.785369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0622  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.59 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0779  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.59 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0617  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3619  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.66 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3501  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.65276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.73 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0145  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.15 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.02 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  25.52 
 
 		 364 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.68 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>