More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0217 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 340 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29790  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  32.43 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  30.24 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.4 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.4 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  34.44 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.15 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.51 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.79 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.86 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  28.49 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.57 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  29.29 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  31.31 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  27.3 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.33 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.33 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.2 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  28.27 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.24 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.95 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.95 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  28.89 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.43 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  30.41 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.6 
 
 		 430 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.1 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.06 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1287  putative aminomethyltransferase  28.2 
 
 		 386 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.3 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.73 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.11 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  32.43 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.59 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  22.7 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.05 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  27.54 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.01 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.46 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.93 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.16 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  27.09 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.33 
 
 		 366 aa  99  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.32 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  27.19 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.33 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.29 
 
 		 781 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  29.22 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.63 
 
 		 403 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  26.52 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.89 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.48 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  30.16 
 
 		 381 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  30.52 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.74 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.79 
 
 		 370 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  27.56 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.01 
 
 		 378 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  25.08 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.55 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  26.61 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.79 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.98 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.3 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  28.13 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.97 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.53 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0670  cylF protein  24.56 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  25.89 
 
 		 889 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.89 
 
 		 1002 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  25.89 
 
 		 1002 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.89 
 
 		 1002 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.33 
 
 		 1003 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.03 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.07 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.22 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  26.52 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.83 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  30.36 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.5 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.55 
 
 		 761 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.02 
 
 		 1003 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.76 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 837 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.02 
 
 		 1003 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>