More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0266 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
362 aa  719    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  62.4 
 
 
375 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  60.94 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  57.96 
 
 
384 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  31.9 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.83 
 
 
342 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.62 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.48 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  29.69 
 
 
364 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  30.19 
 
 
375 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.67 
 
 
370 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  31.1 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.57 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.41 
 
 
363 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.32 
 
 
366 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  29.48 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.89 
 
 
325 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  27.1 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  27.1 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  24.78 
 
 
357 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.28 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.35 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.74 
 
 
441 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  31.73 
 
 
369 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.13 
 
 
430 aa  109  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.26 
 
 
324 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  27.12 
 
 
339 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.55 
 
 
371 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.21 
 
 
357 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.89 
 
 
366 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.11 
 
 
387 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  30.34 
 
 
391 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.08 
 
 
363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  29.04 
 
 
370 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.87 
 
 
365 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.08 
 
 
363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  28.48 
 
 
360 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  33.03 
 
 
369 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  29.48 
 
 
369 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  28.49 
 
 
374 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  35.13 
 
 
396 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.07 
 
 
374 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.7 
 
 
337 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.06 
 
 
372 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  31.34 
 
 
366 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 
403 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  27.06 
 
 
378 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  28.27 
 
 
389 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.47 
 
 
369 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.67 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  29.86 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  26.92 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.14 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3003  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.14 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.56 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.33 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.39 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.17 
 
 
377 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.09 
 
 
372 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.82 
 
 
372 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.79 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.75 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  30.84 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0145  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.14 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  27.73 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0133  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.14 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.79 
 
 
385 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  28.53 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3487  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.27 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.15 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.21 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.71 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  28.09 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29790  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.07 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.87 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1542  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3061  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994.1  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0127  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3926  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.04 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.15 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.94 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.59 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>