More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4246 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4246  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1096    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2464  normal  0.120296 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3108  putative methyl accepting chemotaxis protein  59.43 
 
 
562 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.07 
 
 
562 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3251  hypothetical protein  51.24 
 
 
552 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.367816  normal  0.217501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.76 
 
 
551 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
553 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0628443 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3708  methyl accepting chemotaxis protein  53.13 
 
 
553 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3891  hypothetical protein  47.95 
 
 
551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3083  methyl accepting chemotaxis protein  47.62 
 
 
561 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3810  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 
561 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.296432 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
534 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3303  putative methyl accepting chemotaxis protein, McpG  48.5 
 
 
534 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3299  hypothetical protein  46.05 
 
 
547 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530599  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1401  chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 
569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1404  chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
611 aa  316  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.011031  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.13 
 
 
705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.807181  normal  0.137814 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3682  hypothetical protein  45.58 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.552968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 
569 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4314  methyl-accepting chemotaxis protein  42.53 
 
 
564 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.77703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3262  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 
569 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.846629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2442  methyl accepting chemotaxis protein, McpB  40.46 
 
 
560 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
560 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2985  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
576 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293775  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3432  methyl-accepting chemotaxis protein  45.11 
 
 
519 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0745866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.69 
 
 
554 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.910941  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
519 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268982  normal  0.422774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.79 
 
 
637 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.63 
 
 
677 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.134066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 
546 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 
640 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521589  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1304  methyl-accepting chemotaxis protein  50.14 
 
 
566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.22 
 
 
676 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.63 
 
 
597 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
548 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
602 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495549  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4277  hypothetical protein  40.89 
 
 
555 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.280884  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4671  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
691 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
550 aa  279  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
693 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
640 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.444549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.42 
 
 
566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4817  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.03 
 
 
747 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 
640 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1608  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.68 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4313  methyl-accepting chemotaxis protein  52.34 
 
 
642 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
554 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0219131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1303  methyl-accepting chemotaxis protein  53.44 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7320  methyl-accepting chemotaxis protein  50.27 
 
 
774 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3947  methyl-accepting chemotaxis protein  46.78 
 
 
619 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1300  methyl-accepting chemotaxis protein  48.16 
 
 
563 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0912  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 
551 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
734 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4312  methyl-accepting chemotaxis protein  51.31 
 
 
606 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 
675 aa  266  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 
553 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
563 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
602 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0582253  normal  0.204929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6735  methyl-accepting chemotaxis receptor (MCP)  54.02 
 
 
566 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0787905  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 
599 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1298  methyl-accepting chemotaxis protein  47.59 
 
 
568 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.54 
 
 
544 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 
674 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000495749  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7836  methyl-accepting chemotaxis receptor (MCP)  45.63 
 
 
609 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518607  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
581 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1143  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
541 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7837  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  47.96 
 
 
702 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0785  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
551 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367078  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 
524 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6733  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.89 
 
 
738 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556647  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3297  chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 
543 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
547 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467505  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1140  methyl-accepting chemotaxis protein  47.65 
 
 
727 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.664897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
551 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 
733 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
690 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
1500 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0683  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  37.31 
 
 
568 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.268569  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3420  methyl-accepting chemotaxis protein  38.92 
 
 
524 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
551 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1294  methyl-accepting chemotaxis protein  50.44 
 
 
962 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.88 
 
 
1046 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
550 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 
868 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 
727 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0173671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
559 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.25845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6734  methyl-accepting chemotaxis receptor (MCP)  47.35 
 
 
650 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
617 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.43 
 
 
735 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.650368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.13 
 
 
686 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66893e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1482  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
735 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1207  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.94 
 
 
720 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2944  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
780 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 
823 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
682 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.785168  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
557 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
659 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.261932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1318  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
555 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
846 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>