78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4720 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  80.56 
 
 		 224 aa  327  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  52.47 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  52.17 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  52.17 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  52.17 
 
 		 217 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  50.93 
 
 		 217 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  54.11 
 
 		 218 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  54.11 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  54.11 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  54.11 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  54.59 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  53.14 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  54.59 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  50.24 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0447962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  54.1 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  45.66 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  48.4 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  45.54 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  47.03 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  46.73 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  44.34 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  42.66 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  44.34 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  44.34 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  41.67 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  41.28 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  39.91 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  39.13 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  42.18 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  39.72 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  39.35 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  38.57 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  38.91 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  38.84 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  37.1 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  38.73 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  39.63 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  36.41 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  40.55 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  37.3 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  34.15 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  37.16 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  35.56 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  31.65 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  34.39 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  34.59 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  30.37 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  37.02 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  33.01 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  34.62 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  23.85 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  27.09 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  38.62 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  31.36 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  38.15 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  33.15 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  38.13 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  33.12 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  30.49 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  29.27 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  28.05 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  27.78 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  28.74 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  34.29 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  29.83 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  32.95 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  32.03 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  30.52 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  30.77 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1065  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0701762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  29.69 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  26.19 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  35.87 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>