78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3048 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  42.48 
 
 
233 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  40.37 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  38.1 
 
 
220 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  37.39 
 
 
222 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  40.19 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  38.76 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  37.29 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  37.98 
 
 
228 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  34.56 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  35.2 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  33.96 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  43.59 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  40.22 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  32.09 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0447962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  36.05 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  29.47 
 
 
222 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  31.43 
 
 
220 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  39.13 
 
 
230 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  33.69 
 
 
191 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  31.8 
 
 
217 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  52.13 
 
 
218 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  34.13 
 
 
220 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  30.99 
 
 
215 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  37.43 
 
 
221 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  31.48 
 
 
217 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  31.89 
 
 
240 aa  101  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  34.25 
 
 
218 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  30.41 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  32.97 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  36.84 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  30.04 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  31.28 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  31.67 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  34.21 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  31.67 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  35.37 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  35.37 
 
 
222 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  32.21 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  29.03 
 
 
203 aa  92  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  38.62 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  32.03 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  38.62 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  34.81 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  30.56 
 
 
217 aa  89  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  29.82 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  35.37 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  29.63 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  35.42 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  29.89 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  35.26 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  29.56 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  31.97 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  33.11 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  33.11 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  32.43 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  42.59 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  29.88 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  31.29 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  32.81 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  35.9 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  42.35 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  37.14 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  29.61 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  26.57 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  34.48 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  25.79 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1065  membrane protein-like protein  29.37 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0701762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>