78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3643 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  100 
 
 		 221 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  83.16 
 
 		 224 aa  298  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  53.65 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  55.21 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  57.46 
 
 		 217 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  57.46 
 
 		 217 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  57.46 
 
 		 217 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  52.63 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  52.6 
 
 		 217 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  52.6 
 
 		 217 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  55.73 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  52.6 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  55.73 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  51.56 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  54.17 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  53.3 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0447962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  47.94 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  51.63 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  45.31 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  48.69 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  45.55 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  46.07 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  46.07 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  43.65 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  42.02 
 
 		 225 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  44.38 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  42.08 
 
 		 245 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  42.7 
 
 		 228 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  40.74 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  42.46 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  43.58 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  40.43 
 
 		 228 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  39.68 
 
 		 228 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  39.58 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  38.71 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  39.27 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  36.6 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  38.38 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  41.76 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  41.15 
 
 		 230 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  34.76 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  37.16 
 
 		 217 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  37.7 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  35.56 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  34.39 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  34.59 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  37.02 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  32.97 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  38.31 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  31.38 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  38.62 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  25.54 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  38.15 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  33.15 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  31.43 
 
 		 223 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  26.18 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  32.43 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  38.13 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  33.12 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  29.31 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  28.16 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  27.78 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  28.74 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  29.57 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  34.29 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  29.83 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  32.95 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  32.03 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  30.13 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  30.7 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1065  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0701762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  29.69 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  35.87 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  26.62 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>