79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0455 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  44.19 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  41.94 
 
 
245 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  44.24 
 
 
228 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  40.55 
 
 
225 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  40.98 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  42.66 
 
 
228 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  39.53 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  37.79 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  36.79 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0447962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  39.91 
 
 
228 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  39.63 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  40.37 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  38.71 
 
 
223 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  38.25 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  35.68 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  34.74 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  34.74 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  34.74 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  36.67 
 
 
233 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  41.76 
 
 
190 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  35.35 
 
 
217 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  40.48 
 
 
219 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  35.61 
 
 
220 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  37.09 
 
 
220 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  40.32 
 
 
221 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  34.88 
 
 
217 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  32.55 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  32.55 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  32.55 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  33.02 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  34.88 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  35.78 
 
 
222 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  35.71 
 
 
222 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  33.82 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  37.22 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  41.34 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  34.91 
 
 
213 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  38.25 
 
 
210 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  34.1 
 
 
214 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  38.56 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  35.94 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  35.08 
 
 
191 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  35.62 
 
 
217 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  49.46 
 
 
216 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  38.41 
 
 
230 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  33.33 
 
 
220 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  34.27 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  31.53 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  25.91 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  31.31 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  31.31 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  30.37 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  37.34 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  28.92 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  24.22 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  36.42 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  31.53 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  29.81 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  34.08 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  27.8 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  31.96 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  25.94 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  26 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  37.19 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  30.32 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1065  membrane protein-like protein  28.96 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0701762  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  30.82 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  30.77 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  23.78 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  38.46 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  26.59 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  27.05 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09830  hypothetical protein  31 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0316658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>