77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2005 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  36.8 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  35.34 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  32.32 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  27.49 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  31.09 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  27.91 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  25.79 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  27.43 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  29.24 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  30.56 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  29.91 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  27.71 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  25.65 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  31.78 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  37.36 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  36.63 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  29.23 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  26.32 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  37.89 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  27.52 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  30.93 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  27.88 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  25.57 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  24.59 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  30.88 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  29.61 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  29.36 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  25.45 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  26.85 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  30.48 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  24.54 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  31.3 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  29.91 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  26.37 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  30.28 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  25.57 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  29.81 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  30.48 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  29.17 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  31 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  35.16 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  27.49 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  35.16 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  26.98 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  27.27 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  26.19 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  26.64 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  27.88 
 
 
200 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  29.29 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  26.17 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  22.7 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  29.03 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  30.1 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  22.62 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  30.1 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  24.19 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  24.19 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  24.19 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  28.57 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  28.87 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  26.62 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  29.79 
 
 
224 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  32 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  27.08 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  26.73 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  27.72 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  22.94 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0447962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>