79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3579 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2335  hypothetical protein  95.81 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2795  hypothetical protein  86.05 
 
 		 215 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.192976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2895  hypothetical protein  62.86 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121382  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3121  hypothetical protein  60.28 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3286  hypothetical protein  59.81 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6820  protein of unknown function DUF1345  49.07 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.293707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0559  hypothetical protein  47.93 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643223  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0902  hypothetical protein  46.08 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2467  hypothetical protein  46.08 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2606  hypothetical protein  45.62 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2860  hypothetical protein  51.38 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3681  hypothetical protein  46.73 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454602  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3846  hypothetical protein  46.73 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4518  hypothetical protein  46.73 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3743  hypothetical protein  47.2 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0945338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5569  hypothetical protein  47.2 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2250  hypothetical protein  46.05 
 
 		 217 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0614638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4394  hypothetical protein  44.19 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0447962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4898  hypothetical protein  45.79 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0688072  hitchhiker  0.0000987747 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4720  protein of unknown function DUF1345  44.34 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350385 
 
 
-
 
NC_003296  RS00867  hypothetical protein  46.51 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0492016  normal  0.690964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3643  protein of unknown function DUF1345  46.07 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3943  hypothetical protein  40.28 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0817  protein of unknown function DUF1345  41.1 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0422  hypothetical protein  36.07 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0590  hypothetical protein  39.35 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.889117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0314  hypothetical protein  37.74 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0622  hypothetical protein  37.44 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3436  protein of unknown function DUF1345  40.66 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0524  protein of unknown function DUF1345  37.26 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3735  protein of unknown function DUF1345  40.11 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1722  hypothetical protein  40.11 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0496  hypothetical protein  38.8 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399025  normal  0.0200352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6862  hypothetical protein  33.03 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6780  protein of unknown function DUF1345  39.63 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7622  hypothetical protein  32.24 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0846737  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1397  protein of unknown function DUF1345  33.03 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.79263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3969  hypothetical protein  33.52 
 
 		 248 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3729  protein of unknown function DUF1345  32.09 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0067  protein of unknown function DUF1345  33.64 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1635  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1584  hypothetical protein  36.26 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.740314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3048  hypothetical protein  32.57 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0291  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2123  hypothetical protein  37.91 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.074197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1098  hypothetical protein  33.7 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.524736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0455  hypothetical protein  31.78 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6751  protein of unknown function DUF1345  32.3 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4458  protein of unknown function DUF1345  34.83 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0569  hypothetical protein  33.86 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0219  protein of unknown function DUF1345  26.98 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2211  hypothetical protein  35.67 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4706  protein of unknown function DUF1345  30.77 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.22498  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0865  hypothetical protein  28.73 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.763449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3575  protein of unknown function DUF1345  32.14 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1801  protein of unknown function DUF1345  30.82 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2742  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0412524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0128  hypothetical protein  29.31 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3416  protein of unknown function DUF1345  29.12 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3658  hypothetical protein  31.79 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1817  hypothetical protein  24.18 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1022  hypothetical protein  36.03 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0123  hypothetical protein  28.74 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0948338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3807  protein of unknown function DUF1345  28.19 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35040  predicted membrane protein  31.25 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4121  hypothetical protein  37 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2017  protein of unknown function DUF1345  31.58 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2509  hypothetical protein  36.26 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0187  protein of unknown function DUF1345  27.87 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2005  membrane protein-like  25.48 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0142  hypothetical protein  25.43 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0952556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4153  protein of unknown function DUF1345  37.5 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09830  hypothetical protein  36.08 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0316658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1065  membrane protein-like protein  21.47 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0701762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1176  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.411238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1249  protein of unknown function DUF1345  35.79 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00137426  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0287  protein of unknown function DUF1345  33.7 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>