More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1485 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1444  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  98.55 
 
 		 622 aa  1268    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0386828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1485  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 622 aa  1285    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275641  normal  0.0574258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4948  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.27 
 
 		 600 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.669366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0100  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.25 
 
 		 588 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1762  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  91.04 
 
 		 625 aa  1181    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0561  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.66 
 
 		 622 aa  670    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.76 
 
 		 609 aa  852    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5020  acyl-CoA dehydrogenase family protein  56.23 
 
 		 600 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0505  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  56.23 
 
 		 600 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2922  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.39 
 
 		 617 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1258  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.08 
 
 		 609 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.65 
 
 		 617 aa  716    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130183  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2720  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.16 
 
 		 592 aa  649    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1408  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  80.39 
 
 		 618 aa  1023    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1582  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.27 
 
 		 598 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900007  decreased coverage  0.00956274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.75 
 
 		 600 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0451  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.36 
 
 		 600 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4675  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  64.41 
 
 		 597 aa  760    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7558  Acyl-CoA dehydrogenase  58.75 
 
 		 607 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0382442  normal  0.166512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4473  Acyl-CoA dehydrogenase  68.28 
 
 		 609 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.3 
 
 		 601 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.690717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5757  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.48 
 
 		 600 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.58 
 
 		 588 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.68 
 
 		 591 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2384  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.07 
 
 		 618 aa  680    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.91 
 
 		 600 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0563795  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1227  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.74 
 
 		 599 aa  821    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.556988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2570  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.47 
 
 		 627 aa  715    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215249  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3315  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.32 
 
 		 645 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1687  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.28 
 
 		 642 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.291033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2017  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.23 
 
 		 619 aa  690    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1852  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  80.1 
 
 		 619 aa  1009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.232086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1320  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.73 
 
 		 609 aa  879    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4997  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.2 
 
 		 600 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0860  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.89 
 
 		 609 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0110  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  61.58 
 
 		 588 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66350  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.8 
 
 		 600 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1341  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.89 
 
 		 609 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2877  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.19 
 
 		 652 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2868  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.11 
 
 		 602 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0702  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.28 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1853  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.53 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771828  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2405  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.61 
 
 		 598 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.39 
 
 		 563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2845  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.64 
 
 		 600 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2066  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 		 601 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2141  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.28 
 
 		 616 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01005  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  49.84 
 
 		 611 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.52 
 
 		 599 aa  535  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.77864  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1004  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.88 
 
 		 601 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0861  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.53 
 
 		 601 aa  521  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1076  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.54 
 
 		 606 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.276449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4640  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.77 
 
 		 599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.34 
 
 		 601 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000727045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.9 
 
 		 605 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000583422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.29 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.2 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.73 
 
 		 595 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.28 
 
 		 592 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.06 
 
 		 595 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.79 
 
 		 598 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  38.32 
 
 		 598 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.79 
 
 		 592 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.77 
 
 		 601 aa  360  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  36.73 
 
 		 595 aa  359  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.4 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.36 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  37.84 
 
 		 596 aa  357  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38 
 
 		 598 aa  357  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.72 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.77 
 
 		 595 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0839  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.62 
 
 		 592 aa  355  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.53 
 
 		 594 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  38.33 
 
 		 601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.65 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.67 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.7 
 
 		 594 aa  353  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.55 
 
 		 598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.77 
 
 		 595 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.77 
 
 		 595 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.25 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.73 
 
 		 592 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.51 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.51 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.51 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.7 
 
 		 599 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.51 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  36.94 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.35 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.35 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.35 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.19 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.8 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2265  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.09 
 
 		 598 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.086163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.46 
 
 		 601 aa  346  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  36.62 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>