More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0419 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.59 
 
 		 601 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.76 
 
 		 601 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  75.67 
 
 		 595 aa  945    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  53.69 
 
 		 597 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.44 
 
 		 598 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.47 
 
 		 595 aa  892    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.32 
 
 		 595 aa  896    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.5 
 
 		 601 aa  976    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.59 
 
 		 601 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.02 
 
 		 598 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  884    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.83 
 
 		 601 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.35 
 
 		 594 aa  671    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  884    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  74.83 
 
 		 595 aa  935    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56 
 
 		 626 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  83.56 
 
 		 596 aa  1048    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.72 
 
 		 598 aa  973    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.59 
 
 		 601 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  54.5 
 
 		 598 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  54.26 
 
 		 601 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 596 aa  1232    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  70.81 
 
 		 599 aa  901    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.31 
 
 		 595 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.67 
 
 		 596 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  886    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.26 
 
 		 596 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.04 
 
 		 598 aa  936    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.18 
 
 		 594 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.88 
 
 		 598 aa  978    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.17 
 
 		 601 aa  958    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.5 
 
 		 601 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.55 
 
 		 598 aa  969    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  73.37 
 
 		 598 aa  935    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.93 
 
 		 595 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.67 
 
 		 595 aa  944    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.09 
 
 		 601 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.22 
 
 		 598 aa  988    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  77.89 
 
 		 598 aa  987    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  72.32 
 
 		 595 aa  911    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.42 
 
 		 601 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.17 
 
 		 595 aa  946    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.31 
 
 		 595 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  56 
 
 		 603 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.42 
 
 		 599 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  75 
 
 		 595 aa  936    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  58.06 
 
 		 612 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.48 
 
 		 595 aa  888    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.66 
 
 		 595 aa  923    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.59 
 
 		 601 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.15 
 
 		 595 aa  906    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  71.31 
 
 		 595 aa  905    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.02 
 
 		 598 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.09 
 
 		 598 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.3 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  55.56 
 
 		 601 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2768  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.75 
 
 		 596 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  53.59 
 
 		 596 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.08 
 
 		 596 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0690519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2387  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.24 
 
 		 596 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.6 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.28 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.75 
 
 		 597 aa  628  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.77 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.1 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 592 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.91 
 
 		 596 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.43 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2696  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.42 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.34 
 
 		 592 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.28 
 
 		 597 aa  623  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.1 
 
 		 596 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.26 
 
 		 592 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1723  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.91 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0115108  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.45 
 
 		 598 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2566  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.91 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00594798  hitchhiker  0.000173017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.08 
 
 		 596 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.27 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.91 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439337  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1916  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.92 
 
 		 596 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.839569  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.42 
 
 		 592 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1589  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.41 
 
 		 596 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.59 
 
 		 597 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.84 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.26 
 
 		 592 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.84 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2970  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.25 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108103  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.42 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.42 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0839  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.99 
 
 		 592 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  52.51 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.17 
 
 		 596 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.26 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>