More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1918 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.6 
 
 		 601 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.47 
 
 		 595 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.7 
 
 		 598 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  64.72 
 
 		 598 aa  826    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2263  acyl-CoA dehydrogenase family protein  56.02 
 
 		 606 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.27 
 
 		 601 aa  757    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  60.1 
 
 		 601 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.03 
 
 		 598 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  61 
 
 		 601 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  59.77 
 
 		 601 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0137  acyl-CoA dehydrogenase  53.73 
 
 		 606 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.89 
 
 		 597 aa  695    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.67 
 
 		 601 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.82 
 
 		 606 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.34 
 
 		 595 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.43 
 
 		 601 aa  757    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.27 
 
 		 601 aa  766    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61 
 
 		 601 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  59.2 
 
 		 598 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  60.83 
 
 		 601 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.3 
 
 		 595 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.79 
 
 		 599 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.29 
 
 		 595 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.95 
 
 		 595 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.77 
 
 		 599 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.3 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.79 
 
 		 595 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.8 
 
 		 595 aa  758    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.84 
 
 		 595 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.06 
 
 		 597 aa  702    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  59.5 
 
 		 601 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  53.29 
 
 		 595 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.3 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  78.93 
 
 		 599 aa  1015    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.83 
 
 		 603 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0148  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.57 
 
 		 606 aa  659    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.06 
 
 		 597 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.51 
 
 		 595 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.12 
 
 		 595 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.3 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.96 
 
 		 606 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 600 aa  1252    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.01 
 
 		 595 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.6 
 
 		 601 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.75 
 
 		 598 aa  799    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  52.17 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.51 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  50.84 
 
 		 597 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3891  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.83 
 
 		 606 aa  630  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.33 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.42 
 
 		 597 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  49.58 
 
 		 597 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47600  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.74 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.52 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.34 
 
 		 594 aa  618  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4106  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.41 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.25 
 
 		 595 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.6 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.41 
 
 		 597 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.41 
 
 		 597 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.49 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.93 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.24 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.75 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.5 
 
 		 598 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.49 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.01 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.25 
 
 		 597 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.1 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0023  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.17 
 
 		 598 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.1 
 
 		 598 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  50.42 
 
 		 596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.26 
 
 		 598 aa  605  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0380  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.58 
 
 		 596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 		 595 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.84 
 
 		 612 aa  598  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3693  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.24 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.67 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2048  acyl-CoA dehydrogenase, putative  49.07 
 
 		 616 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.681425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  48.66 
 
 		 592 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.42 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.58 
 
 		 592 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.67 
 
 		 596 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.42 
 
 		 592 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.83 
 
 		 592 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.66 
 
 		 592 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68510  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.41 
 
 		 596 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0032913  normal  0.251007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5930  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.24 
 
 		 596 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.49 
 
 		 592 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.06 
 
 		 591 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.56 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3245  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.5 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.532993  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.65 
 
 		 596 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  49 
 
 		 598 aa  588  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>