156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1049 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  100 
 
 
290 aa  583  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  42.56 
 
 
291 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  41.07 
 
 
281 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  41.55 
 
 
284 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  42.35 
 
 
282 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  42.2 
 
 
282 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.98 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  39.79 
 
 
282 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  39.79 
 
 
282 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  39.44 
 
 
282 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  39.44 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  39.44 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  39.44 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  40.79 
 
 
293 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  35.51 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.66 
 
 
283 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  37.33 
 
 
163 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  27.21 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  26.51 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  24.74 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  28.12 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.55 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.32 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.73 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.66 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.5 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.57 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.94 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  22.34 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.28 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.72 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.24 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.24 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  28.52 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  24.52 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  23.89 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  24.25 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.93 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  28.18 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.97 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.13 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  26.32 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  24.37 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.04 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.04 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  23.41 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  23.51 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  26.3 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.14 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  22.18 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.05 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.05 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.48 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.15 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.16 
 
 
310 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.65 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.26 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.32 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  26.16 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.17 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  24.05 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.93 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.3 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.59 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  23.26 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.92 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.74 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.71 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  21.68 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.46 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  24.59 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  24.66 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.79 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.15 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.4 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  22.65 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  21.77 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  22.48 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  26.67 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0686  F0F1 ATP synthase subunit gamma  19.73 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0122169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  25 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  25.91 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  22.95 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  22.97 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  21.58 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.15 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1521  ATP synthase F1, gamma subunit  23.76 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0011878  hitchhiker  3.23025e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  24.01 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  20.7 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  22.85 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.8 
 
 
295 aa  52.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.97 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  21.9 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  20.68 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  24.16 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  22.19 
 
 
310 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>