281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2708 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0844  ATP synthase F1, gamma subunit  34.06 
 
 
290 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  30.07 
 
 
289 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.03 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  27.57 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.61 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.61 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  27.56 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  28.82 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.84 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.53 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.42 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.42 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  29.73 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.42 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  26.6 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.75 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.75 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.75 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  25.7 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.83 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.92 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.59 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.6 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  23.96 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  23.78 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.39 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  27.04 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.4 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  23.43 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  26.42 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0326  ATP synthase F1, gamma subunit  22.26 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.07 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.52 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  23.67 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.14 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.04 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.75 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.38 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.4 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  26.14 
 
 
309 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.81 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.95 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.95 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.27 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0107  ATP synthase F1, gamma subunit  24 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0013955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.48 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2047  hypothetical protein  52.78 
 
 
103 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.726464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1707  ATP synthase F1, gamma subunit  52.78 
 
 
103 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  25.54 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.6 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.97 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2607  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.55 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.99 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  25.69 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  21.48 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  24.05 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.1 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.16 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl114  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.05 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.03 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.26 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.63 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  24.73 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.9 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.63 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.05 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  25.16 
 
 
315 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.77 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  23.45 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.3 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.3 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.1 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.47 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.91 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1980  ATP synthase F1, gamma subunit  23.34 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.73 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.29 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29009  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  25.9 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.859793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.05 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.77 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>