More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2780 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  100 
 
 
291 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  56.42 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  52.48 
 
 
281 aa  260  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.58 
 
 
284 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  46.45 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  43.21 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  44.29 
 
 
282 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  44.29 
 
 
282 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  44.29 
 
 
282 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  44.29 
 
 
282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  44.29 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  44.29 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  42.56 
 
 
290 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  46.07 
 
 
293 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  38.73 
 
 
283 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.38 
 
 
283 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  39.04 
 
 
163 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  28.34 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  23.65 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.21 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1521  ATP synthase F1, gamma subunit  23.53 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0011878  hitchhiker  3.23025e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.08 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.66 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.78 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.41 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  27.33 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.9 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.9 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.52 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.52 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  23.37 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.75 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.5 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.5 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.85 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.53 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.26 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.51 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  25.95 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  28.28 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.93 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  24.15 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.21 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.43 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  21.84 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.15 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.09 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.03 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  25.08 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.28 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0588  ATP synthase F1, gamma subunit  25.87 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.118844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.09 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.12 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  26.39 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.68 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.7 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.17 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.53 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  27.85 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.27 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.56 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  26.15 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.68 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.92 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.34 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  25.95 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.4 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  24.05 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  27.44 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.26 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  19.24 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.17 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.94 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.96 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.18 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.26 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.26 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  25.16 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  25 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.5 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.96 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.84 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.57 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.53 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.34 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.53 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.53 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>