More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1432 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  37.33 
 
 
290 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  39.04 
 
 
291 aa  90.9  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.06 
 
 
300 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  39.29 
 
 
315 aa  77.8  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  35.92 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  35.92 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  35.92 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  36.15 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  36.81 
 
 
282 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  36.81 
 
 
282 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  36.81 
 
 
282 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.27 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  39.1 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.07 
 
 
283 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  34.07 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.48 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  34.06 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.82 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.29 
 
 
284 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.19 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.85 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.75 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  41.18 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.75 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.26 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.54 
 
 
286 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  31.75 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.06 
 
 
286 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.26 
 
 
286 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
286 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  30.87 
 
 
293 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  30.07 
 
 
303 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  33.64 
 
 
292 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  31.25 
 
 
282 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 
287 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
288 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3493  ATP synthase F1, gamma subunit  38.27 
 
 
291 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.03 
 
 
288 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4873  ATP synthase F1, gamma subunit  38.27 
 
 
291 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.92 
 
 
288 aa  61.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.96 
 
 
290 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.96 
 
 
290 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.74 
 
 
287 aa  60.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.5 
 
 
289 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  35.24 
 
 
301 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.26 
 
 
286 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5413  ATP synthase F1, gamma subunit  37.04 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.842934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  30.97 
 
 
295 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  30.07 
 
 
302 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
295 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.2 
 
 
287 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.77 
 
 
289 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  40.54 
 
 
286 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
287 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.6 
 
 
288 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0507  ATP synthase F1, gamma subunit  40.79 
 
 
290 aa  58.9  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  43.42 
 
 
326 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.54 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
289 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
289 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.26 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 
287 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  31.79 
 
 
292 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  30.23 
 
 
289 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>