196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0042 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  56.42 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  54.65 
 
 
284 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.94 
 
 
281 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  51.57 
 
 
282 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  48.11 
 
 
282 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  49.22 
 
 
282 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  49.22 
 
 
282 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  49.22 
 
 
282 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  48.84 
 
 
282 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  48.45 
 
 
282 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  48.45 
 
 
282 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  48.22 
 
 
293 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  38.98 
 
 
290 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.31 
 
 
283 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  36.92 
 
 
283 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  30.66 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.62 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  29.93 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.82 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  32.24 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  24.9 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  35.07 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.09 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  25.94 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.24 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.38 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  29.84 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.63 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.43 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  24.07 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.07 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.96 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.96 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  24.56 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  23.75 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.23 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.18 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.94 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.08 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.08 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.76 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  27.33 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  23.91 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.31 
 
 
294 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.38 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.38 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.38 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.76 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.96 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.38 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.5 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.09 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  25.72 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.52 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  24.63 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.37 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  26.57 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.28 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.64 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  21.85 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.54 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.71 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.91 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.91 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.68 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  26.76 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.45 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.64 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  25.09 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.79 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  26.01 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  24.72 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2607  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.43 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.79 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.75 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.05 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  24.44 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.05 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.34 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  23.83 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.63 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.73 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.44 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.28 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.17 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  25.38 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  25.64 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.81 
 
 
288 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  24.07 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
290 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  24.91 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.2 
 
 
290 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.04 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  26.32 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  26.42 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.19 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>