164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5552 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5552  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1886  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  71.99 
 
 
284 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143819  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0427  ATP synthase F1, gamma subunit  56.63 
 
 
282 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1047  ATP synthase gamma chain  56.07 
 
 
282 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2644  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.07 
 
 
282 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2786  putative ATP synthase F1, gamma subunit  55.71 
 
 
282 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0131  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.07 
 
 
282 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1299  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.07 
 
 
282 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0155  putative ATP synthase F1, gamma subunit  56.07 
 
 
282 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0042  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.57 
 
 
283 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1121  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  55.96 
 
 
293 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19750  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  48.92 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2780  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  46.45 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1049  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  42.2 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3936  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  38.52 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0549887  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4104  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.52 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.791184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3057  H+transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.57 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0443  ATP synthase F1, gamma subunit  26.99 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0305537  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0896  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  24.74 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  25.81 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2328  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.86 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  25.24 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0471  ATP synthase F1, H+-transporting two-sector ATPase gamma subunit  22.1 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0106314  normal  0.135636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3098  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  25.27 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0775855  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.59 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.59 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  23.36 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  23.89 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.84 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  21.71 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1071  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  24.14 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1169  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  22.3 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  29.07 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.48 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2676  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23.79 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648062  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  24.66 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1432  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.05 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  27.05 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2708  ATP synthase F1, gamma subunit  27.04 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0944  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit gamma  22.76 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  26.58 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.83 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.76 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.18 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1962  H+transporting two-sector ATPase gamma subunit  22.22 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  23.48 
 
 
369 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  25.83 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  24.75 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0291  ATP synthase F1, gamma subunit  22.7 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.57 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  24.65 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.65 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  25.08 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.57 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  24.58 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.77 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.31 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2335  hypothetical protein  23.93 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.89 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  23.68 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.92 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.4 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  24.16 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.88 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1737  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.11 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.371278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.4 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  24.17 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2997  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  26.03 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1653  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.48 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.926709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.29 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  46.38 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  22.97 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  19.51 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.9 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1557  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.16 
 
 
292 aa  52.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.9 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.94 
 
 
290 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.35 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.47 
 
 
292 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  24.18 
 
 
308 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.87 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.5 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  21.05 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.75 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  18.87 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.75 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.13 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.16 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.19 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  23.99 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  23.08 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.031727  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  18.77 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0269811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  21.02 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  22.65 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  24.22 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>