More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2453 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2453  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 283 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2163  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 283 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.86 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.16 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.64 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.65 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.17 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.49 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  40.28 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.33 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.72 
 
 		 289 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.86 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  35.2 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.34 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.64 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  38.75 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.94 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  34.9 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.84 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.6 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  36.64 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.68 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.51 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.51 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  34.26 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000126351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  36.24 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.72 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.72 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.15 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  35.09 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.72 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.41 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.4 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  37.05 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  37.05 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.24 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.4 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.92 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  32.99 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.02 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.38 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  32.45 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  35.05 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.91 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  35.57 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  32.65 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.64 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  34.15 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.79 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.92 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>