More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0652 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0269811  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0388  F0F1 ATP synthase subunit gamma  82.92 
 
 
281 aa  488  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.803559  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1233  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.32 
 
 
290 aa  218  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.72576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.95 
 
 
296 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
290 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.45 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.79 
 
 
292 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
293 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.91 
 
 
294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  36.55 
 
 
292 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.3 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.03 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
291 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.55 
 
 
294 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.9 
 
 
296 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
289 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
290 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 
294 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
289 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.78 
 
 
295 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
289 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.56 
 
 
296 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.83 
 
 
287 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.62 
 
 
287 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
292 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.84 
 
 
293 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.11 
 
 
290 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
291 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.12 
 
 
302 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  34.95 
 
 
294 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  36.79 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.88 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.15 
 
 
287 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.8 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.12 
 
 
292 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.89 
 
 
291 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.12 
 
 
292 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.87 
 
 
287 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
293 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.29 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.56 
 
 
292 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0175  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  31.96 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.66 
 
 
292 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.335228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0531  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 
292 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
283 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.22 
 
 
290 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.14 
 
 
288 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.14 
 
 
288 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  32.79 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.32 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  33.77 
 
 
293 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.74 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
283 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.41 
 
 
293 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  31 
 
 
297 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  30 
 
 
309 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.87 
 
 
282 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.35 
 
 
281 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.07 
 
 
291 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.42 
 
 
295 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.93 
 
 
286 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.24 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.79 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.14 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.21 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.83 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.79 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.55 
 
 
286 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.39 
 
 
288 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.11 
 
 
295 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.66 
 
 
286 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.91 
 
 
293 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.15 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.55 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.19 
 
 
288 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.56 
 
 
293 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.24 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  29.45 
 
 
288 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.15 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.21 
 
 
286 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.15 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.15 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.69 
 
 
286 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.05 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.19 
 
 
288 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.77 
 
 
288 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.55 
 
 
289 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.12 
 
 
294 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.4 
 
 
286 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.47 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  28.47 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>